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Proteines, structure, fonction et regulations. Protéomique.
Responsable Gilles Rautureau
L’objectif est d’aborder les notions indispensables en biochimie des protéines, qui sont indispensables pour tous les biologistes, tant au niveau conceptuel que pratique au laboratoire. Ces notions sont indispensables pour les autres UE du cursus de bio de l'ENS de Lyon (biologie cellulaire, expression et sauvegarde des génomes, épigénétique M1, …) Ce module potentialise le TP « Méthodes » du L3 S5. Le TP permettra l’application des connaissances vues en cours et le TP sera valorisé par les bases théoriques (par exemple sur l’enzymologie, la purification des protéines etc.)
Le contenu du cours :
- Niveaux de structure
- Repliement, entonnoir énergétique et interactions hydrophobes
- Flexibilité et instabilité, les protéines intrinsèquement non repliées
- Les modification post-traductionnelles
- Purification des protéines (chromatographies affinité, échangeuse d'ions, exclusion stérique, hydrophobe...)
- La modulation de l’activité des protéines
- Epissage des proteines, shedding, moonlighting, crypteines
- Protéomique et spectrométrie de masse, électrophorèse bidimensionnelle
- Enzymologie fondamentale (Enzyme Michaelienne, Km, kcat, représentations (Hanes-Woolf, double inverse, eadie hofstee), inhibiteur (compétitif, non compétitif, incompétitif).
- Bases de bio-énergétique (Enthalpie libre standard, Enthalpie libre, équilibre (Keq), rapport d'action de masse)
- Interactions biomoléculaires
- Exemples de relation structure fonction (ATP synthase, Complexe III chaine respiratoire, hexokinase I, GMP synthase, nucléotidase (ISN1) ...)