M1 UE Microbiologie moléculaire et biologie cellulaire des infections

Responsable : Chloé Journo

6 crédits ECTS

Enseignantes et enseignants statutaires :

Résumé

L'objectif de cette UE est d'approfondir les interactions mises en jeu entre les micro-organismes infectieux et leur(s) hôte(s), d'un point de vue moléculaire, cellulaire et structural. Les stratégies infectieuses seront illustrées à l'aide d'exemples issus du monde viral et bactérien, et mises en perspective de la structure des micro-organismes. Des ouvertures vers la physiopathologie des infections seront proposées en fin d'UE.

Thèmes couverts

• Mécanismes d'entrée et de trafic des micro-organismes intra-cellulaires
• Mécanismes de multiplication des micro-organismes infectieux
• Facteurs de virulence viraux et bactériens, pathogenèse
• Mécanismes de résistance cellulaire aux agents infectieux, mécanismes d'échappement des pathogènes
• Transfert de gènes, évolution et émergence des agents infectieux
• Résistance aux antibiotiques
• Virologie structurale
• Introduction à la bactériologie structurale
• Agents infectieux non conventionnels
• Physiopathologie des infections, infections et cancers

Prérequis

Cette UE s'inscrit dans la continuité des UE "Microbes et Immunité" proposées en L3. Il est recommandé mais non obligatoire d'avoir suivi l'UE optionnelle de S6 "Microbes et Immunité : nouveaux concepts", ainsi que le TP "Microbes et Immunité".

Pour les étudiantes et étudiants n'ayant pas suivi la L3 de l'ENS de Lyon, il est recommandé d'avoir suivi une UE ou plusieurs UE équivalentes.

Objectifs disciplinaires

A l'issue de l'UE, l'étudiant·e devra être capable de :

• Décrire les modalités d'interactions moléculaires et cellulaires mises en jeu entre les micro-organismes infectieux et leur hôte, sur quelques exemples choisis, et les liens avec la pathogenèse des infections.
• Décrire les mécanismes de défenses anti-infectieuses de l'hôte, et les stratégies d'échappement des micro-organismes.
• Expliquer les mécanismes d'évolution et d'émergence des micro-organismes infectieux.
• Comprendre les méthodes de microbiologie moléculaire et cellulaire et analyser les résultats expérimentaux qui en découlent.
• Exploiter les données de biologie structurale pour décrire les structures moléculaires des micro-organismes et les lier à leurs propriétés infectieuses.

Compétences transversales

A l'issue de l'UE, l'étudiant·e se sera exercé·e à :

• Stabiliser un socle de connaissances essentielles à tout biologiste tout en acquérant une maîtrise plus approfondie de thématiques d'intérêt.
• Acquérir des connaissances scientifiques actuelles et de pointe.
• Observer, décrire, quantifier et interpréter des données simples et complexes.
• S’exprimer et communiquer des résultats expérimentaux et des concepts biologiques, à l’écrit et à l’oral.

Modalités de contrôle des connaissances

• Contrôle continu oral (25% de la note finale) : préparation et présentation d’un poster sur un micro-organisme infectieux étudié dans les laboratoires de Lyon, par groupe, en présence d'un·e chercheur·e spécialiste invité·e.
• Contrôle continu écrit (25% de la note finale de l’UE) : durée 1h à mi-UE, questions de cours et d’analyse de données expérimentales.
• Contrôle terminal écrit (50% de la note finale) : durée 2h en fin d'UE, questions de cours et d’analyse de données expérimentales.

Bibliographie

• Microbiologie de Prescott
• Principles of Virology (Flint)